婴儿脑积水在胎儿时期的常见原因主要有以下几方面。首先是先天性发育异常，约有2/3的婴儿脑积水是由先天性因素导致。比如神经管发育畸形，在胚胎发育早期，神经管闭合过程出现障碍，就可能引发脑积水相关的脑室系统发育异常情况。
胎儿时期的先天发育因素
神经管发育问题： 胚胎在发育到第15 - 25天的时候，神经管开始闭合，如果这个过程出现异常，就容易导致脑室系统的结构发生改变，进而引发脑积水。例如，叶酸缺乏可能会增加神经管发育畸形的风险，从而间接影响胎儿脑积水的发生。染色体异常： 一些染色体疾病也与胎儿脑积水有关。像21 - 三体综合征（唐氏综合征）等染色体异常疾病，会影响胎儿的正常发育，其中脑部发育异常是常见表现之一，可能导致脑积水情况出现。
母体因素影响
孕期感染： 孕妇在孕期感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒等。如果孕妇在怀孕早期感染了风疹病毒，大约有10% - 20%的胎儿会出现先天性的脑积水等神经系统畸形。因为病毒可以通过胎盘影响胎儿的脑部发育，干扰脑脊液的正常循环和吸收。孕期接触有害物质： 孕妇在孕期接触放射性物质或者某些有毒化学物质，也可能增加胎儿脑积水的发生风险。比如长期处于高浓度的铅环境中，铅会影响胎儿脑部的正常发育过程，干扰脑脊液的代谢和循环，进而引发脑积水。
胎儿自身脑脊液循环障碍因素
脑室系统结构异常： 胎儿自身脑室系统的结构存在先天性的狭窄等情况，会阻碍脑脊液的正常循环。例如中脑导水管狭窄，这是较为常见的导致胎儿脑积水的原因之一。中脑导水管狭窄会使脑脊液从脑室流向蛛网膜下腔的通道受阻，导致脑脊液在脑室内积聚，引起脑室扩张，进而形成脑积水。脉络丛病变： 胎儿时期脉络丛如果出现病变，比如脉络丛乳头状瘤等，会影响脑脊液的分泌。正常情况下脉络丛会分泌脑脊液，如果其分泌功能异常或者分泌的脑脊液循环受阻，都可能导致脑室系统内脑脊液积聚，引发脑积水。