治疗鼻腔溃疡可以使用的药物有多种，一般局部用药为主，比如常用的复方薄荷脑滴鼻液，能起到湿润鼻腔、促进溃疡愈合的作用，通常可以每日使用2 - 3次。
局部抗炎类药物
复方氯己定含漱液：如果鼻腔溃疡伴有感染迹象，可将其稀释后用于鼻腔局部清洗，能起到一定的抗炎作用，但使用时要注意避免误咽。红霉素眼膏：可以涂抹在鼻腔内，起到抗炎、保护溃疡面的作用，一般每天涂抹2 - 3次。
促进愈合类药物
重组牛碱性成纤维细胞生长因子凝胶：直接涂抹在鼻腔溃疡处，能促进溃疡组织的修复和再生，加快愈合速度，使用时要注意保持鼻腔清洁干燥。康复新液：用棉球蘸取康复新液后涂抹在鼻腔溃疡部位，也有助于溃疡的愈合，一般每天可涂抹3 - 4次。
保湿润滑类药物
甘油：简单的甘油也可以起到湿润鼻腔的作用，防止鼻腔过于干燥加重溃疡，但单独使用效果相对有限，可配合其他药物一起使用。液体石蜡油：滴入鼻腔能起到润滑鼻腔、防止黏膜干燥的效果，对于因干燥引起的鼻腔溃疡有一定的缓解作用，一般每次滴入1 - 2滴即可。对于儿童患者，使用鼻腔溃疡药物时要格外小心，尽量选择温和、刺激性小的药物，且在使用前最好咨询医生意见。同时，在使用药物治疗鼻腔溃疡期间，要注意保持鼻腔清洁，避免用力擤鼻和挖鼻，饮食上要多吃富含维生素的蔬菜水果，避免食用辛辣刺激性食物，这样有助于鼻腔溃疡更好地愈合。