扁平尤是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性赘生物，治疗方法有多种，其中物理治疗相对较有效。一般来说，激光治疗是比较常用的物理方法，通常1 - 2次激光治疗可能改善症状，但具体情况因人而异。
物理治疗方式
激光治疗：利用激光的高能量瞬间破坏疣体组织。治疗时会有轻微疼痛，不过现在有局部麻醉等方式减轻不适。一般较小的扁平尤一次激光治疗即可，较大或多发的可能需要多次。冷冻治疗：通过低温使疣体组织坏死脱落。冷冻治疗后局部可能出现水疱、结痂等，通常1 - 3周左右疣体逐渐脱落，可能需要2 - 3次治疗才能完全清除。
外用药物选择
咪喹莫特乳膏：它是一种免疫调节剂，通过刺激机体的免疫系统来发挥作用。一般每周使用3次，连续使用8 - 12周，部分人使用后扁平尤会逐渐消退，但起效相对较慢，且可能引起局部皮肤刺激反应，如红肿、瘙痒等。氟尿嘧啶软膏：能抑制细胞的增殖。使用时要注意避免接触正常皮肤，可能会出现局部刺激症状，如烧灼感、红肿等，孕妇禁用。
免疫调节治疗
干扰素：可增强机体的免疫功能来对抗HPV感染。可以通过局部注射或肌肉注射的方式给药。局部注射可能会有注射部位疼痛等不适，肌肉注射可能会出现发热、乏力等全身反应，一般需要较长时间的治疗才能看到效果。但免疫功能正常的人使用可能效果相对较好，免疫功能低下者可能效果欠佳。扁平尤患者在治疗过程中要注意保持皮肤清洁，避免搔抓疣体，防止自身接种传播。同时，治疗后要按照医生的要求定期复诊，观察恢复情况。如果是儿童患者，家长要密切关注孩子治疗后的反应，因为儿童皮肤较为娇嫩，治疗时需更加谨慎。