慢性肾功能衰竭的治疗需要综合多方面来进行。一般来说，慢性肾功能衰竭的治疗要根据病情阶段等因素来制定方案，通常会涉及多个方面的干预。
一般治疗方面
饮食调整： 要限制蛋白质摄入，根据肾功能情况，一般每天蛋白质摄入量可控制在0.6~0.8克/千克体重左右，同时要保证热量充足，每天热量摄入约30~35千卡/千克体重。还要控制钠盐摄入，一般每天钠盐摄入应少于3克，水肿明显时更要严格限制。控制血压： 常用血管紧张素转换酶抑制剂（ACEI）或血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂（ARB）类药物，这类药物不仅能降压，还能减少尿蛋白，延缓肾功能恶化。比如贝那普利等药物，可通过抑制肾素 - 血管紧张素 - 醛固酮系统来发挥作用。
并发症治疗方面
纠正贫血： 常用促红细胞生成素，一般需要皮下或静脉注射，使血红蛋白逐渐提升到110~120克/升左右。同时要补充铁剂，如硫酸亚铁等，保证铁的摄入充足，以促进红细胞生成。治疗钙磷代谢紊乱： 当出现低钙高磷时，可补充钙剂，如碳酸钙等，同时使用磷结合剂，如碳酸镧等，来降低血磷水平。
肾脏替代治疗方面
血液透析： 一般每周进行2~3次，每次透析时间约4小时左右。通过血液透析可以清除体内的代谢废物和多余水分，维持内环境稳定。但长期血液透析可能会带来一些并发症，如低血压等。腹膜透析： 可在家中进行，通过腹膜来清除体内毒素和多余水分。腹膜透析需要注意防止腹膜炎等并发症，一般每天需要进行4~5次换液操作。肾移植： 是治疗慢性肾功能衰竭的有效方法之一，但需要找到合适的供体，且术后需要长期服用免疫抑制剂，如环孢素等，以防止排斥反应，但免疫抑制剂可能会带来感染等风险。