细菌性结膜炎的临床症状表现主要有眼部刺激感，通常患者会感觉眼睛有异物感、灼热感等，这种不适可能会持续数小时到数天不等。另外，眼部会出现分泌物增多的情况，分泌物的性质因病情不同有所差异，一般是黏性或脓性分泌物，严重时早晨起床可能会发现眼皮被分泌物黏住，影响睁眼。
眼部充血情况
结膜充血： 患者的结膜会呈现明显的充血状态，表现为眼白部分发红，这是因为炎症刺激导致结膜血管扩张。一般来说，这种充血会比较均匀地分布在整个结膜表面。眼睑充血： 同时眼睑也可能出现充血，触摸时可能会有轻度肿胀的感觉，用手轻轻按压眼睑，能感觉到轻微的压痛。
眼部其他不适症状
疼痛： 部分患者会有眼部疼痛的感觉，疼痛程度因人而异，有的患者是轻微的刺痛，有的可能较为明显。疼痛可能会在眨眼时加重，影响正常的眼部活动。畏光： 患者可能会出现畏光的现象，在光线较强的环境中，眼睛会不自主地眯起，以减轻光线对眼睛的刺激。这是因为炎症刺激了眼部的感觉神经，导致眼睛对光线敏感。
不同类型细菌性结膜炎的特殊表现
急性细菌性结膜炎： 起病较急，通常在感染后1 - 3天内发病，眼部刺激症状更为明显，分泌物大量增多，呈脓性，早上起床时睁眼困难的情况比较常见，而且可能伴有耳前淋巴结肿大。慢性细菌性结膜炎： 症状相对较轻，持续时间较长，可能会持续数周甚至数月。眼部有轻度的瘙痒感、异物感，分泌物一般为黏液性，早晨起床时眼部可能会有少量的黏性分泌物。