女性肚脐眼里面疼可能与以下原因有关：
一、急性胃肠炎：
1.通常与不洁饮食、幽门螺杆菌感染等因素相关。
2.主要表现为腹泻、恶心、呕吐以及腹部绞痛等症状，部分病例会出现脐部或脐周疼痛，这多是由于炎症刺激所引发的肠道痉挛导致。
3.在明确病因后需要给予针对性的治疗，比如因细菌感染可应用喹诺酮类抗生素，必要时还可给予颠茄合剂来改善疼痛症状。
二、痛经：
1.在月经期间，如果女性出现痛经，严重时可能会引起肚脐眼的牵涉性疼痛。
2.痛经时要做好防寒保暖措施，避免食用生冷食物，若疼痛明显则需要及时就医进行完善的妇科检查。
3.若无器质性病变，对于单纯的原发性痛经，可以在医生指导下服用布洛芬等止痛药物来缓解。
三、脐炎：
1.若手部不卫生而直接对肚脐眼进行抠挖，导致皮肤损伤后细菌侵袭就可能引发脐炎，进而出现肚脐眼疼痛。
2.可视情况采取碘伏消毒、口服头孢或青霉素类抗生素（前提是不过敏）等措施进行处理，疼痛会随着病情的好转而减轻。
四、急性阑尾炎：
1.起病初期可能会出现脐周疼痛，主要考虑是炎症刺激神经引发的反射性疼痛，同时还伴有恶心、呕吐等症状。
2.随后疼痛可转移至右下腹且固定，同时还会出现肌紧张、反跳痛。
3.通常会采取腹腔镜下阑尾切除术进行治疗。
女性肚脐眼里面疼的原因还有很多，建议及时就医，查明原因后遵医嘱进行治疗，以免延误病情。