新生儿呼吸窘迫综合征主要通过支持治疗等综合手段来治疗。一般来说，治疗需在新生儿重症监护室进行。
氧疗支持
鼻塞持续气道正压通气（CPAP）： 通过鼻塞给予持续的气道正压，维持肺泡在呼气末的开放，改善氧合。对于轻度到中度的新生儿呼吸窘迫综合征患儿，可优先考虑CPAP，能减少气管插管的需求。机械通气： 当CPAP效果不佳时，需进行机械通气。根据患儿的情况调节潮气量、呼吸频率、吸入氧浓度等参数，以保证有效的气体交换，维持合适的氧合和通气，但要注意避免气压伤等并发症。
肺表面活性物质替代治疗
补充肺表面活性物质： 肺表面活性物质可以降低肺泡表面张力，使肺泡在呼气末不易萎陷。通常在确诊新生儿呼吸窘迫综合征后尽早给药，一般生后12小时内使用效果较好。目前有多种人工合成或动物提取的肺表面活性物质可供选择，通过气管内滴入等方式给药。
液体管理
合理控制液体入量： 要维持新生儿的液体平衡，避免液体过多加重肺水肿，同时也不能液体不足导致循环灌注不良。一般根据新生儿的日龄、体重、病情等调整液体入量，通常每天液体量控制在60 - 80ml/kg左右，但需个体化调整，密切监测患儿的出入量、电解质等情况。
其他支持措施
保温： 需将新生儿置于合适的中性温度环境中，维持体温在36.5 - 37.5℃，以减少能量消耗和氧耗。可使用辐射保暖台或暖箱等设备来维持体温稳定。监测与抗感染： 密切监测新生儿的生命体征，如心率、呼吸、血压、血氧饱和度等。同时，对于有感染风险的患儿，可能需要根据情况使用抗生素进行抗感染治疗，但要严格掌握用药指征，避免不必要的抗生素使用。