注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠可能出现的副作用主要有以下几方面：
胃肠道反应方面
恶心呕吐： 部分患者使用该药物后可能出现恶心症状，严重时会伴随呕吐情况。一般在用药过程中较为常见，但多数程度较轻，不过也有少数人反应较明显。腹泻： 有的患者会出现腹泻症状，大便次数可能会增多，每天可能数次不等，轻者可能只是大便性状稍稀，重者可能呈水样便。
血液系统方面
血小板减少： 用药后可能影响血小板的数量，导致血小板减少。不过这种情况相对不是很常见，但一旦出现需要引起重视，可能会表现为皮肤有瘀点、瘀斑等情况。凝血功能异常： 由于头孢哌酮可能影响维生素K的代谢，长期或大量使用注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠可能导致凝血功能异常，比如凝血酶原时间延长等，增加出血的风险，像皮肤黏膜出血、鼻出血等情况可能会发生。
过敏反应方面
皮肤过敏： 可能出现皮疹，表现为皮肤出现红色斑丘疹等，可伴有瘙痒感。严重的可能出现荨麻疹，皮肤瘙痒明显，皮疹范围可能较广。过敏性休克： 虽然比较罕见，但一旦发生过敏性休克则非常危险，会出现呼吸困难、血压下降、意识丧失等严重表现，需要立即进行抢救处理。
肝肾功能方面
肝功能异常： 少数患者使用后可能出现肝功能指标异常，如转氨酶升高等，但一般在停药后可逐渐恢复。肾功能影响： 一般来说常规剂量下对肾功能影响不大，但对于本身有肾功能不全的患者，使用时需要密切监测肾功能变化，因为药物主要通过肾脏排泄，可能会加重肾脏负担。