三岁宝宝反复发烧的原因包括病毒感染、细菌感染、先天性心脏病等，具体如下：
一、病毒感染：如呼吸道合胞病毒、腺病毒、EB病毒等都可能引发三岁宝宝反复发烧。这是因为病毒侵袭宝宝机体后，会引发免疫系统的反应，从而导致发热症状。对于这种情况，可以给三岁宝宝使用抗病毒药物来进行治疗，像蒲地蓝消炎口服液具有清热解毒、抗炎消肿的作用；抗病毒颗粒能清热祛湿、凉血解毒等。
二、细菌感染：像大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等细菌，可能致使三岁宝宝反复发烧。由于细菌感染会导致体内炎症反应，进而引起体温升高。此时可以给宝宝服用抗生素进行治疗，例如阿莫西林胶囊可用于敏感菌所致的感染；头孢克肟颗粒对部分细菌感染有较好疗效。
三、先天性心脏病：若三岁宝宝患有先天性心脏病，容易使肺循环出现充血状态，进而诱发支气管肺炎，而支气管肺炎往往会伴有发烧现象，所以三岁宝宝反复发烧可能是先天性心脏病引起的。针对这种情况，可通过手术的方式来治疗先天性心脏病，从而达到解决三岁宝宝反复发烧的目的。
总之，当三岁宝宝出现反复发烧时，要及时查找原因，根据具体病因采取相应的治疗措施，以保障宝宝的健康。