慢性腹泻的原因有多种。一般来说，肠道感染是常见原因之一，比如细菌感染可能持续数周甚至更长时间，像一些沙门氏菌感染就可能引发慢性腹泻。
肠道感染因素
细菌感染： 某些细菌如大肠埃希菌、沙门氏菌等感染肠道后，会导致肠道黏膜炎症，影响肠道的正常吸收和分泌功能，从而引起慢性腹泻。这些细菌感染往往病程相对较长，可能持续数周。病毒感染： 轮状病毒、诺如病毒等感染肠道后，也可能造成慢性腹泻情况。例如轮状病毒感染多见于婴幼儿，可导致较长时间的腹泻症状。
肠道非感染性疾病因素
炎症性肠病： 像克罗恩病和溃疡性结肠炎，是慢性非特异性肠道炎症性疾病。克罗恩病可累及全消化道，从口腔到肛门的任何部位，会出现腹痛、腹泻等症状，且病程较长。溃疡性结肠炎主要累及直肠和结肠，表现为反复发作的腹泻、黏液脓血便等。肠易激综合征： 这是一种常见的功能性胃肠病，与胃肠动力异常、内脏高敏感等因素有关。患者会出现腹痛、腹泻，症状可持续或反复发作，病程可长达数年甚至更久，且精神因素等可诱发或加重症状。
全身性疾病因素
甲状腺功能亢进： 甲状腺激素分泌过多，会加快机体新陈代谢，影响肠道功能，导致肠道蠕动加快，出现腹泻症状，这种腹泻一般是慢性的，同时还可能伴有多汗、心慌等甲亢相关症状。糖尿病： 糖尿病患者如果血糖控制不佳，可能会出现自主神经病变，影响胃肠道的神经调节，导致胃肠功能紊乱，引起慢性腹泻，还可能伴有多饮、多食、多尿等糖尿病表现。