附睾结核的治疗主要以抗结核药物治疗为主，一般需要规范用药6~12个月。
抗结核药物治疗
常用药物： 异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等是治疗附睾结核的常用抗结核药物。这些药物通过抑制结核菌的生长繁殖来发挥作用。例如异烟肼能抑制结核菌DNA合成，阻碍细菌生长。用药原则： 要遵循早期、联合、适量、规律、全程的原则。早期用药可及时杀灭结核菌；联合用药能减少耐药菌产生，像异烟肼联合利福平就是常见组合；用药量要合适，过多可能增加不良反应，过少达不到杀菌效果；必须按照规定的时间规律服药，不能随意停药；要全程用药，保证彻底杀灭结核菌，一般疗程至少6个月，严重的可能需要12个月。
手术治疗情况
手术适应证： 当附睾结核形成较大脓肿，经药物治疗后脓肿不缩小；或者附睾结核病灶破坏严重，药物治疗效果不佳；还有附睾结核合并阴囊窦道形成时，就需要考虑手术治疗。手术方式： 常见的手术有附睾切除术，如果病变累及睾丸，可能需要做睾丸附睾切除术。但手术前后都需要继续抗结核治疗，一般术前要抗结核治疗2周左右，术后还要继续用药6个月以上。
治疗中的注意事项
定期复查： 治疗过程中要定期复查，包括血常规、肝肾功能以及附睾部位的超声等检查。血常规可以了解有无血液系统不良反应，肝肾功能检查能监测药物对肝肾功能的影响，超声可以观察附睾结核病灶的变化情况。一般治疗开始后的前2个月，每2周复查一次，之后每月复查一次。生活方式调整： 患者要注意休息，保证充足的睡眠，避免过度劳累，因为劳累可能影响身体免疫力，不利于结核的治疗。同时要加强营养，多吃富含蛋白质、维生素的食物，如鸡蛋、牛奶、新鲜蔬菜水果等，以增强身体抵抗力，但要避免食用辛辣、刺激性食物。另外，要避免性生活过度，防止病情加重或传染他人。