肝功能正常但肝区疼痛，可能与以下几方面有关：一是肝脏局部损伤，二是肝脏代谢能力差，三是肝炎后综合征。
一、肝脏局部存在肝组织损伤，对肝脏包膜产生刺激，从而引发肝区疼痛。然而此时肝脏整体功能尚未受到显著影响，所以肝功能检查显示正常。比如肝脏可能受到一些轻微的物理性刺激或其他局部因素影响，导致了局部组织的损伤，但还未累及到整个肝脏的功能。
二、肝脏的代谢能力欠佳，难以满足人体的正常代谢需求，进而导致肝区出现不适、隐痛等情况，可肝功能检查却尚未能发现异常。这可能是肝脏在长期的负荷下，其代谢功能有所减弱，但还没有达到能在常规检查中体现出来的程度。
三、在经历严重的肝脏损伤后，肝功能或许已经恢复正常，肝功能检查也没有异常表现，但肝区依然存在不适症状。这种状况一般被称作“肝炎后综合征”。可能是之前的损伤对肝脏造成了一些持久的影响，虽然功能上看似恢复了，但实际上仍有一些后遗问题。
总之，一旦出现肝区疼痛，即便肝功能检查未见异常，也必须高度重视。应该寻求专业医生的帮助，进行后续的检查与处理。