怀孕三个多月肚子痛可能由以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫随着胎儿的生长而逐渐增大，可能会牵拉子宫周围的韧带，引起腹部轻微疼痛。这种疼痛通常是阵发性的，休息后可以缓解。
2.胃肠道问题：怀孕后，孕妇的胃肠道功能可能会受到影响，容易出现消化不良、便秘等问题，这些问题也可能导致肚子痛。
3.先兆流产：如果肚子痛同时伴有阴道流血，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行保胎治疗。
4.其他原因：怀孕期间，孕妇还可能出现其他问题，如阑尾炎、胆囊炎等，这些疾病也可能导致肚子痛。
如果怀孕三个多月肚子痛，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规等，以确定疼痛的原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇在怀孕期间要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心情，合理饮食，有助于胎儿的健康发育。