小孩子肠胃炎可以根据症状选择合适药物，一般常用的有益生菌、肠黏膜保护剂等。比如益生菌类药物，像双歧杆菌等，能调节肠道菌群，帮助改善肠胃炎引起的肠道功能紊乱，通常可以在药店购买到，价格相对较为亲民，一般一盒几十元不等。
益生菌类药物
调节肠道菌群： 双歧杆菌可以抑制有害菌的生长，维持肠道微生态平衡，对小孩子因肠胃炎导致的肠道菌群失调有较好的调节作用。嗜酸乳杆菌： 能分泌乳酸，降低肠道pH值，抑制病原菌繁殖，帮助缓解肠胃炎引发的腹泻等症状。
肠黏膜保护剂
蒙脱石散： 它可以覆盖在肠黏膜表面，吸附病原体和毒素，起到保护肠黏膜的作用，小孩子肠胃炎出现腹泻时可以使用。一般用温水冲服，按照说明书剂量服用。铝碳酸镁： 能中和胃酸，保护胃黏膜，对于肠胃炎伴有胃酸过多、腹痛的小孩子有一定缓解作用，但使用时需遵医嘱。
止吐药物
多潘立酮混悬液： 如果小孩子肠胃炎伴有严重呕吐，多潘立酮混悬液可以促进胃肠道蠕动，起到一定的止吐作用，但2岁以下儿童使用需谨慎，必须在医生指导下应用。昂丹司琼： 对于剧烈呕吐的情况有较好的止吐效果，但一般是在其他治疗效果不佳且医生评估后使用。
补液药物
口服补液盐Ⅲ： 小孩子肠胃炎容易出现脱水和电解质紊乱，口服补液盐Ⅲ可以补充水分和丢失的电解质，预防和纠正脱水。按照说明书配置后给小孩子服用，一般小包装的口服补液盐Ⅲ价格实惠，一袋能冲成一定量的补液溶液。