前列腺囊肿一般由多种原因导致。先天性因素是其中一个方面，比如中肾导管与中肾旁管发育异常，管腔部分扩张就可能形成前列腺囊肿。在胚胎发育时期，中肾导管与中肾旁管的发育过程出现异常，就会有这种情况发生。
先天性发育异常导致
苗勒管退化不全： 在男性胎儿发育过程中，苗勒管应该正常退化，如果退化不全，就可能形成前列腺囊肿相关的结构异常情况。这是由于胚胎时期的发育程序出现了偏差所导致的。中肾导管异常： 中肾导管如果发生异常扩张等情况，也会参与到前列腺囊肿的形成过程中。中肾导管在正常发育时会有特定的走向和结构变化，当出现异常时就会引发囊肿相关问题。
后天性因素导致
炎症感染引起： 前列腺的慢性炎症会使腺泡梗阻，逐渐形成潴留性囊肿。比如前列腺炎没有得到及时有效的治疗，长期的炎症刺激会让腺泡发生梗阻，进而导致囊肿形成。像一些细菌性前列腺炎如果没有规范治疗，就容易出现这种情况。寄生虫感染导致： 比如寄生虫如包虫能使前列腺管及周围发生慢性炎症，或者引发肉芽增生，最终形成囊肿。当人体感染包虫等寄生虫后，寄生虫在前列腺部位引起炎症反应，逐步导致囊肿的产生。
其他因素导致
前列腺腺管堵塞： 前列腺腺管如果发生堵塞，分泌的液体无法正常排出，就会积聚形成囊肿。腺管堵塞的原因可能有多种，比如一些微小的结石等堵塞物导致腺管不通畅。退行性变： 前列腺腺泡发生退行性改变时，也可能逐渐形成囊肿。随着年龄的增长，前列腺组织会发生一定的退行性变化，在这个过程中如果出现腺泡的异常改变，就有可能引发囊肿。