胸腺瘤的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。目前并没有确切的数据能精准指出胸腺瘤由某一单一因素绝对引起，但已知一些相关的高危情况。
与遗传因素的关联
有研究表明，部分胸腺瘤的发生可能与遗传易感性有关。某些特定的基因变异可能会增加个体患胸腺瘤的风险。不过，这种遗传因素并非是绝对导致胸腺瘤发生的唯一原因，只是在发病机制中起到一定作用。例如，某些家族中可能存在特定的基因缺陷，使得家族成员相对其他人更易患上胸腺瘤，但也不是家族中的每个人都会必然发病。
与免疫系统的关系
免疫系统异常也可能参与胸腺瘤的发生。人体的免疫系统能够识别和清除异常细胞，但当免疫系统出现紊乱时，就可能无法有效监控和清除胸腺部位的异常细胞，从而导致胸腺瘤细胞的增殖。比如，一些自身免疫性疾病患者，其免疫系统处于失衡状态，这类人群患胸腺瘤的几率可能会相对增高。不过，这也不是绝对的，只是免疫系统的异常变化与胸腺瘤的发生有一定的关联。
与环境因素的联系
长期暴露在某些环境因素下也可能增加胸腺瘤的发病风险。例如，长期接触某些化学物质，像一些工业化学污染物等。虽然目前还没有确凿的证据表明特定的某一种化学物质肯定会引发胸腺瘤，但长期处于不良的环境化学暴露中，会对人体的细胞产生不良影响，可能干扰细胞的正常生长和调控机制，进而为胸腺瘤的发生创造条件。另外，长期受到辐射影响，比如接受过胸部放射性治疗等，也可能与胸腺瘤的发生有一定关系，但同样不是所有接触这些环境因素的人都会患上胸腺瘤，只是增加了发病的可能性。