胸腺瘤的病因目前尚未完全明确，不过有一些相关因素被认为可能与之有关。
遗传因素相关
家族遗传倾向： 有研究发现，部分胸腺瘤患者存在一定的家族遗传背景。如果家族中有亲属患过胸腺瘤，那么个体患胸腺瘤的风险可能会相对增加，但具体的遗传方式还不是完全清晰，目前已知不是单一基因的简单遗传模式，而是多基因参与以及环境等因素共同作用的结果。基因变异影响： 某些基因的变异可能与胸腺瘤的发生有关。比如一些涉及细胞生长、增殖、凋亡等调控的基因发生突变或异常表达时，可能会导致胸腺上皮细胞异常增殖，进而引发胸腺瘤。不过目前对于具体是哪些基因以及如何通过基因变异引发胸腺瘤的机制还在进一步研究中。
环境因素影响
辐射暴露： 长期接触辐射，例如接受过胸部放疗的人群，患胸腺瘤的风险会有所升高。有数据显示，在接受过胸部高剂量辐射的人群中，胸腺瘤的发病几率比普通人群要高一些。这是因为辐射可能会损伤细胞的DNA，导致细胞发生异常改变，从而增加了患胸腺瘤的可能性。化学物质接触： 长期接触某些化学物质，像一些工业化学毒物等，也可能与胸腺瘤的发生存在关联。虽然具体的作用机制还不十分明确，但有研究推测这些化学物质可能会干扰人体正常的细胞代谢和调控过程，破坏细胞的正常生长秩序，使得胸腺组织出现异常增生，逐渐发展为胸腺瘤。不过目前关于特定化学物质与胸腺瘤的确切关系还需要更多的研究来证实。
免疫系统相关
免疫功能异常： 当人体免疫系统出现异常时，可能更容易引发胸腺瘤。例如自身免疫性疾病患者，由于免疫系统紊乱，对自身组织的识别和调控出现问题，可能会影响胸腺的正常功能，导致胸腺上皮细胞发生异常变化。比如重症肌无力患者常合并胸腺瘤，这提示免疫系统的异常可能在胸腺瘤的发生发展中起到一定作用。免疫系统的异常会打破机体原本对细胞生长和分化的正常调控，使得胸腺内的细胞失去正常的平衡，进而促使胸腺瘤的形成。