肛瘘是否会癌变与治疗是否及时有关。具体如下：
一、肛瘘的形成：肛管直肠周围的脓肿破溃后，会致使肛管直肠与周围皮肤形成肉芽肿性管道，进而造成肛瘘。
1.及时治疗不会癌变：肛瘘一般是感染性疾病，会有脓性分泌物出现，但通常不会有恶变的细胞或组织。若能及时进行如肛瘘切开术、肛门瘘管切开术等手术治疗，是能够促进其恢复的。
(1)肛瘘切开术：通过切开瘘管，敞开引流，能有效清除感染源。
(2)肛门瘘管切开术：能直接处理瘘管，达到治疗目的。
2.长期不治疗可能癌变：如果长期不对肛瘘进行处理，肛瘘周围及管道中可能会形成瘢痕组织，这些瘢痕组织在长期炎症刺激下，可能会出现恶变，从而导致癌变发生。
总之，对于肛瘘要重视，及时治疗可避免不良后果，若久拖不治则可能引发严重问题。