小腹一阵一阵疼可能由多种原因引起，比如女性生理期时，约有60% - 90%的女性会出现不同程度的小腹疼痛，一般在月经来潮前1 - 2天开始，经期第一天最剧烈，持续2 - 3天缓解。
生理因素导致的小腹疼
月经期小腹疼： 女性在月经期间，子宫内膜前列腺素含量增高，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现痛经，表现为小腹一阵一阵疼。一般月经第1天疼痛最剧烈，随后逐渐减轻。排卵期小腹疼： 部分女性在排卵期时，成熟的卵子从卵巢排出，可能会刺激腹膜，出现一侧下腹隐痛，呈一阵一阵的感觉，疼痛通常较轻微，持续数小时至1 - 2天会自行缓解。
病理因素导致的小腹疼
肠道疾病： 如肠炎，多由细菌、病毒感染或饮食不当引起。细菌感染导致的肠炎可能出现小腹一阵一阵疼，同时伴有腹泻、大便次数增多，每天可达3 - 10次不等，大便多为稀便或黏液便。泌尿系统疾病： 像输尿管结石，当结石在输尿管内移动时，会引起输尿管平滑肌痉挛，出现小腹阵发性绞痛，疼痛较为剧烈，可向会阴部放射，同时可能伴有血尿，小便中可看到红色血丝或血块。妇科疾病： 如盆腔炎，多发生在性活跃期、有月经的女性。盆腔炎会导致盆腔充血、炎症刺激，出现小腹持续或阵发性疼痛，还可能伴有发热，体温可达到38℃左右，以及阴道分泌物增多等症状。
其他可能因素
腹部着凉： 腹部受到寒冷刺激后，胃肠道平滑肌会发生痉挛，引起小腹一阵一阵疼，同时可能伴有腹泻等表现。比如在寒冷天气穿着过少，腹部暴露在外，就容易出现这种情况。