舌头上长溃疡的主要原因有多种，比如约20%-30%的复发性阿弗他溃疡与遗传因素有关，若家族中有多人经常长口腔溃疡，那么其他人患复发性阿弗他溃疡的几率会相对较高。
一、局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到舌头，或者说话时牙齿刮到舌头，就容易引发溃疡。这种情况在进食过快、注意力不集中的人群中较为常见。尖锐牙尖刺激： 牙齿有过磨损、龋坏等导致形成尖锐的牙尖，长期刺激舌头黏膜，也会促使溃疡形成。比如长期存在的锐利残根、残冠，会不断摩擦舌头相应部位。
二、全身因素影响
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B族时，像维生素B2、B6等缺乏，就容易长口腔溃疡。有研究表明，长期素食者相对更易出现因维生素缺乏导致的舌溃疡，这类人群体内维生素摄入不足，就可能引发口腔黏膜问题。免疫力低下： 当身体免疫力下降时，比如患有某些慢性疾病、长期熬夜、过度劳累等情况，身体抵御病原体的能力减弱，就容易受到病菌侵袭，从而引发舌溃疡。例如，艾滋病患者由于免疫力严重低下，常常会反复出现口腔黏膜溃疡，包括舌头溃疡。
三、其他因素
精神因素： 长期处于精神紧张、焦虑、压力大的状态下，会影响人体的内分泌和免疫系统，增加舌溃疡发生的概率。比如学生在考试期间、职场人士面临重大项目时，舌溃疡的发生率可能会有所上升。食物过敏： 个别人群对某些食物过敏，食用后可能会引发口腔黏膜的过敏反应，表现为舌头上出现溃疡样改变。比如对芒果过敏的人，吃了芒果后就可能出现舌头部位的过敏溃疡。