治萎缩性胃炎常用的药物有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。一般来说，根据病情不同用药方案有差异，比如常用的抑酸剂有奥美拉唑等，它能抑制胃酸分泌，缓解因胃酸过多导致的不适，通常需要按疗程使用。
抑酸剂的作用
奥美拉唑：属于质子泵抑制剂，能特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌，可有效缓解萎缩性胃炎患者因胃酸刺激引起的胃痛、反酸等症状，疗程一般可能需要4 - 8周左右。兰索拉唑：也是质子泵抑制剂，作用机制与奥美拉唑类似，能抑制胃酸分泌，对萎缩性胃炎伴有胃酸相关不适的患者适用，用药后能在一定程度上改善胃部不适状况。
胃黏膜保护剂的应用
枸橼酸铋钾：在胃内酸性条件下形成弥散性的保护层覆盖于溃疡面上，促进溃疡黏膜再生和溃疡愈合，还能杀灭幽门螺杆菌，对于萎缩性胃炎患者保护胃黏膜有一定作用，服用时要注意按照医嘱，一般服用后可能会出现舌苔和大便发黑的情况，这是正常现象。铝碳酸镁：能迅速中和胃酸，并保持很长时间，同时还能吸附和结合胆汁，保护胃黏膜，可用于缓解萎缩性胃炎患者的烧心、胃痛等症状，服用时一般建议在餐后1 - 2小时服用。
促胃肠动力药的使用情况
多潘立酮：能增加胃蠕动，促进胃排空，协调胃与十二指肠运动，可用于改善萎缩性胃炎患者出现的腹胀、早饱等消化不良症状，成人常用剂量下一般能起到较好的促胃肠动力效果，但儿童使用需谨慎，要在医生指导下应用。莫沙必利：也是促胃肠动力药，通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5 - HT4受体，促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善萎缩性胃炎患者的胃肠动力不足问题，对老年人等人群的胃肠动力改善也有一定帮助，但使用时要注意观察是否有腹泻等不良反应。
针对幽门螺杆菌的药物联用
如果萎缩性胃炎患者合并幽门螺杆菌感染，通常会采用四联疗法，即一种质子泵抑制剂（如上述的奥美拉唑、兰索拉唑等）+两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素等）+一种铋剂（如枸橼酸铋钾等）。比如常用的组合是奥美拉唑+阿莫西林+克拉霉素+枸橼酸铋钾，通过联合用药来根除幽门螺杆菌，从而缓解萎缩性胃炎的病情，但具体用药方案需由医生根据患者实际情况制定，且要注意抗生素的使用禁忌等情况。