低氯性碱中毒通常是由多种原因引起的。一般来说，胃肠道丢失胃酸是常见原因之一，比如严重呕吐，持续呕吐会使大量含氯的胃酸丢失，从而导致低氯性碱中毒，这种情况在幽门梗阻患者中较为常见。
肾脏排氯增加导致
利尿剂使用： 长期或大量使用噻嗪类利尿剂等，会影响肾脏对氯的重吸收，使氯排出增多，进而引发低氯性碱中毒。例如，一些高血压患者长期服用噻嗪类利尿剂控制血压时，就可能出现这种情况。盐皮质激素过多： 原发性醛固酮增多症患者，由于体内醛固酮水平过高，会促进肾脏远曲小管和集合管对钠的重吸收以及钾和氢的排出，同时也会影响氯的排泄，导致氯丢失过多，引起低氯性碱中毒。
摄入不足相关因素
营养不良： 长期营养不良的人群，可能会出现氯摄入不足的情况，如果同时存在其他导致碱中毒的因素，就容易引发低氯性碱中毒。比如一些长期节食减肥且饮食不均衡的人。特殊胃肠道引流： 进行胃肠减压等特殊胃肠道引流操作时，如果引流液中含氯较多，长时间引流也可能导致氯丢失过多，引发低氯性碱中毒。