阴茎疼可能由多种原因引起。比如，包皮龟头炎是常见原因之一，据统计，成年男性中约有一定比例会受到包皮龟头炎的困扰，它通常是由于细菌、真菌等病原体感染，或者局部卫生状况不佳导致，会出现阴茎局部红肿、疼痛等症状。
炎症性因素导致阴茎疼
龟头炎： 多因细菌感染或局部刺激引发，除了阴茎疼，还会看到龟头红肿、有分泌物等情况。比如白色念珠菌感染引起的龟头炎，就可能让阴茎出现疼痛不适。尿道炎： 当尿道发生炎症时，也可能牵扯到阴茎导致疼痛。像淋菌性尿道炎，是由淋球菌感染引起，会有尿道流脓、阴茎疼痛等表现。
外伤导致阴茎疼
性生活损伤： 如果性生活中动作过于粗暴，可能会造成阴茎海绵体损伤等，从而引起阴茎疼痛。一般这种情况在事后很快就能发现阴茎有疼痛不适。外力撞击： 阴茎受到外力直接撞击，比如运动时碰撞到硬物等，会立刻出现疼痛，还可能伴有肿胀等情况。
泌尿系统结石导致阴茎疼
尿道结石： 尿道内存在结石时，会引起阴茎部位的疼痛，还可能出现排尿困难等症状。结石较小的时候可能会在排尿过程中刺激尿道导致疼痛。膀胱结石： 当膀胱结石排出过程中经过尿道时，也可能引发阴茎疼痛，同时伴有排尿中断等现象。
其他因素导致阴茎疼
阴茎硬结症： 患者阴茎海绵体白膜会出现纤维化硬结，可导致阴茎勃起时疼痛、弯曲等，发病年龄多在40 - 60岁之间。阴茎癌： 虽然相对少见，但也会引起阴茎疼痛，同时阴茎局部可能有肿块、溃疡等异常表现，需要引起重视。