霉菌性阴道炎主要由假丝酵母菌引起，治疗一般以抗真菌药物为主，通常7~14天为一个疗程。
药物治疗选择
局部用药： 常用的有克霉唑制剂，比如克霉唑栓，每晚1粒（150mg），连用7日；或每晚1粒（200mg），连用3日。还有咪康唑制剂，像咪康唑栓，每晚1粒（200mg），连用7日；或每晚1粒（400mg），连用3日。另外，制霉菌素制剂也可选用，制霉菌素栓每晚1粒（10万U），连用10~14日。全身用药： 对于不能耐受局部用药、未婚女性及不愿采用局部用药者，可选用口服药物。常用药物有氟康唑，单次口服150mg即可。
治疗中的注意事项
暂停性生活： 在治疗霉菌性阴道炎期间，应避免性生活，因为性生活可能会加重病情，还可能将病菌传染给性伴侣。注意个人卫生： 要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，洗净的内裤最好用开水烫洗后在阳光下暴晒，以消灭病菌。
特殊人群的处理
孕妇： 孕妇患霉菌性阴道炎需格外谨慎，因为孕期激素水平变化易诱发霉菌性阴道炎。一般以局部用药为主，不建议口服药物，具体用药需在医生指导下进行，选择对胎儿影响小的药物。糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖高，阴道内糖原含量也高，适合假丝酵母菌生长繁殖，容易反复发生霉菌性阴道炎。这类患者除了积极治疗阴道炎外，还需要积极控制血糖，将血糖控制在合理范围内，才能减少霉菌性阴道炎的复发。