男科生殖器短小的治疗方法主要包括改善饮食、加强运动、使用药物、进行理疗以及手术等。具体情况如下：
一、改善饮食：
当出现生殖器短小的情况时，应及时调整饮食结构，保持营养均衡，减少刺激性食物的摄入，这样有助于维持生殖器的正常功能。
二、加强运动：
适当进行诸如跑步、跳绳等体育运动，能够促进身体的血液循环，对局部组织也有一定的改善效果，在一定程度上可缓解不适。
三、使用药物：
此时还可以在医生的指导下使用十一酸睾酮软胶囊、甲睾酮片、枸橼酸西地那非片等药物来缓解不适，这些药物能够促使生殖增长、增大。
四、进行理疗：
常见的理疗方式包括推拿、艾灸、针灸等，它们可以起到疏通经络、调理气血等作用，对生殖器的延长能起到辅助效果。理疗需要在专业医生的指导下进行。
五、手术：
如果对自身生殖器的大小非常不满意，可以遵循医生的建议通过手术进行干预，从而增加阴茎的周径或长度。
如果身体出现不适，建议及时就医并按照医生的指导进行相关治疗。虽然运动对生殖器短小有一定帮助，但不会明显改变其大小。
总结概况提示：男科生殖器短小有多种治疗途径，患者可根据自身具体情况选择合适的方法，同时要注意及时就医和遵循医嘱。