葡萄胎的发生主要与受精卵异常有关，大约有80%~90%的完全性葡萄胎是由于父源染色体的过度复制导致的，而部分性葡萄胎通常是由一个正常卵子和两个精子受精引起。
营养因素相关情况
缺乏维生素A及前体物质和动物脂肪： 研究发现，饮食中缺乏维生素A及其前体物质（如胡萝卜素）以及动物脂肪的女性，发生葡萄胎的几率相对较高。比如长期素食且不注重补充相关营养的女性，可能面临更高风险。叶酸缺乏： 叶酸对细胞的正常分裂和发育很重要。如果孕妇体内叶酸水平不足，可能增加葡萄胎的发生风险。有调查显示，在葡萄胎患者中，约有一定比例的人存在叶酸代谢相关的异常情况，导致叶酸利用障碍。
内分泌失调方面
卵巢功能状态： 卵巢功能异常会影响激素的分泌和调节。比如卵巢黄体功能不足时，会使得孕激素分泌减少，影响子宫内膜的正常蜕膜化，从而干扰胚胎的正常发育，增加葡萄胎发生的可能。一般来说，女性在35岁以上怀孕时，卵巢功能相对较弱，发生葡萄胎的风险比年轻女性要高一些。促性腺激素水平： 体内促性腺激素水平异常也与葡萄胎有关。当促性腺激素尤其是绒毛膜促性腺激素（hCG）分泌异常时，会影响滋养细胞的正常增生和分化。有研究发现，部分葡萄胎患者的血清hCG水平明显高于正常妊娠同期的水平。
染色体异常情况
完全性葡萄胎的染色体： 完全性葡萄胎的染色体核型几乎全部为二倍体，来自父系，常见的是46XX核型，是由一个缺失染色体的空卵与一个单倍体精子（23X）受精，然后精子的染色体发生复制而成为二倍体（46XX）；也有少数是46XY核型，是由一个空卵分别和两个单倍体精子（23X和23Y）受精而成。部分性葡萄胎的染色体： 部分性葡萄胎的染色体核型通常是三倍体，最常见的核型是69XXY，是由一正常卵子分别与两个精子受精所致，即双精子受精。