一般来说，酸奶在饭后30分钟到2小时之间喝最好。
这是因为此时胃酸被食物稀释，胃内的酸碱度更适合乳酸菌生长。同时，乳酸菌可以促进肠胃蠕动，有助于食物的消化和吸收。此外，晚上睡前喝酸奶也有一定的好处，因为夜间血钙水平较低，酸奶中的钙可以补充血钙的不足，还能缓解血钙下降引起的肌肉兴奋性增加的问题，有助于预防抽筋。
需要注意的是，酸奶不能空腹喝，因为空腹时胃内的胃酸较多，乳酸菌易被胃酸杀死，保健作用会减弱。同时，酸奶中的乳酸菌不耐高温，加热会杀死乳酸菌，因此酸奶不宜加热后饮用。此外，酸奶含糖量较高，糖尿病患者需要谨慎饮用。