囊实性卵巢囊肿是否严重不能一概而论，一般来说，约10%~15%的卵巢囊肿可能为恶性，但具体情况需综合多种因素判断。
从性质判断严重程度
良性囊实性卵巢囊肿：大部分囊实性卵巢囊肿是良性的，比如卵巢子宫内膜异位囊肿，它是子宫内膜异位到卵巢形成的，一般生长相对缓慢，患者可能有痛经、月经异常等表现，但通过规范治疗，如药物治疗或手术切除等，预后通常较好。恶性囊实性卵巢囊肿：少数囊实性卵巢囊肿可能是恶性的，像卵巢浆液性囊腺癌等，恶性囊肿生长速度往往较快，容易发生转移，会严重威胁患者的生命健康，需要及时进行手术、化疗等综合治疗，但预后相对较差。
从大小判断严重程度
较小的囊实性卵巢囊肿：直径小于5厘米左右的囊实性卵巢囊肿，很多时候没有明显症状，可能在体检时偶然发现，这种情况相对没那么严重，可定期复查超声，观察囊肿变化情况。较大的囊实性卵巢囊肿：直径大于5厘米的囊实性卵巢囊肿，发生扭转、破裂等并发症的风险会增加。比如囊肿发生扭转时，会引起剧烈腹痛，需要紧急手术处理；若发生破裂，可能导致腹腔内出血等严重情况，相对就比较严重。
从症状表现判断严重程度
无症状的囊实性卵巢囊肿：有些囊实性卵巢囊肿患者没有任何不适症状，往往是通过体检发现，这种情况相对隐匿，但也不能掉以轻心，仍需密切随访。有症状的囊实性卵巢囊肿：如果囊实性卵巢囊肿引起了明显症状，如腹痛、腹胀、月经紊乱等，就需要引起重视，可能提示囊肿有不良变化或对周围组织产生了压迫等影响，需要进一步评估并积极处理。