卵巢囊肿是否严重不能一概而论，大部分卵巢囊肿是良性的，并不严重，但也有少部分可能比较严重。比如直径小于5厘米的单纯性囊肿，很多是生理性的，可能在几个月经周期内自行消失，这种情况就不严重。
生理性卵巢囊肿情况
排卵后形成的囊肿：女性排卵后，卵泡液流出，卵泡壁塌陷形成黄体，如果黄体血肿没有吸收，就可能形成黄体囊肿，一般直径在3~5厘米左右，通常会在2~3个月经周期内自然消退，这种情况不需要特殊处理。滤泡囊肿：是最常见的生理性囊肿，多发生在育龄女性，是由于卵泡不成熟或者成熟后不排卵，卵泡持续存在形成的，一般直径较小，多数小于5厘米，多数可自行消失。
病理性卵巢囊肿情况
子宫内膜异位囊肿：也叫巧囊，是子宫内膜异位到卵巢上形成的囊肿，囊肿内含有类似巧克力样的粘稠液体。这种囊肿会逐渐增大，可能会引起进行性加重的痛经、不孕等问题，如果囊肿较大，还有破裂、扭转的风险，相对比较严重。浆液性囊腺瘤或粘液性囊腺瘤：属于卵巢的良性肿瘤，但有一定恶变可能。一般肿瘤直径超过5厘米时，就建议手术切除，以防发生恶变风险。卵巢癌：这是恶性程度较高的卵巢囊肿，早期可能没有明显症状，发现时往往已到晚期。卵巢癌的预后相对较差，5年生存率较低，但早期诊断和治疗可以改善预后。
不同人群卵巢囊肿的差异
育龄女性：育龄女性出现卵巢囊肿时，需要密切观察囊肿的变化。如果是生理性囊肿，可等待几个月经周期后复查；如果是病理性囊肿，根据具体情况决定治疗方案。绝经后女性：绝经后女性发现卵巢囊肿，要高度警惕恶性肿瘤的可能，因为绝经后卵巢囊肿恶变的几率相对较高，一般建议尽快手术切除，明确囊肿性质。