茎突过长综合征主要有咽部症状、耳部症状、颈部症状等表现。一般来说，咽部症状较为常见，约有超过半数的患者会出现咽部异物感，这种异物感通常比较顽固，像有东西卡在喉咙里一样。
咽部症状：异物感与疼痛
异物感： 患者常能感觉到咽部有持续的异物感，位置多在扁桃体区、舌根等部位，有时还会伴有刺痛感，这种异物感在吞咽时可能会更明显，比如吞咽口水或者进食时都能感觉到。疼痛： 疼痛可放射至耳部或颈部，疼痛性质多样，有的是刺痛，有的是牵拉痛等，疼痛程度因人而异，有的患者疼痛较轻，仅在特定动作时出现，而有的患者疼痛较为剧烈，影响正常的吞咽和说话。
耳部症状：牵涉性耳痛
耳痛表现： 茎突过长可能会引起牵涉性耳痛，疼痛一般位于单侧耳朵，可表现为隐痛、刺痛或胀痛等。这种耳痛容易被误诊为耳部本身的疾病，比如中耳炎等，但通过检查茎突情况可能会发现问题。听力影响： 少数患者可能会出现听力下降的情况，不过相对来说这种情况比较少见，多是因为茎突过长影响了耳部周围的神经和结构导致的。
颈部症状：颈部疼痛
颈部牵拉痛： 患者可能会感觉到颈部有牵拉痛，疼痛部位多在颈部一侧，当头部转动或者颈部活动时，疼痛可能会加重。例如头部向对侧转动时，颈部的牵拉痛会明显增强。颈部不适感： 除了疼痛外，还可能有颈部的不适感，患者会感觉颈部有异物牵拉感或者沉重感，影响颈部的正常活动和舒适度。