亚急性甲状腺炎多在病毒感染后1~3周发病，常见表现有甲状腺部位疼痛，这种疼痛可放射至耳部，一般持续1~2周，少数患者疼痛会持续数月。
甲状腺局部表现
甲状腺肿大：多数患者甲状腺会出现不同程度的肿大，可单侧肿大，也可双侧肿大，肿大的甲状腺质地较硬。压痛情况：患者触摸肿大的甲状腺时往往有明显压痛，吞咽时疼痛可能会加重。
全身症状表现
发热：约半数患者会出现发热症状，体温一般在38℃左右，少数患者体温可高达39℃以上，发热可持续1~3周。全身不适：患者还可能伴有全身乏力、肌肉酸痛等不适症状，影响日常活动。
甲状腺功能变化相关表现
甲亢期表现：在疾病早期，由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放入血，部分患者会出现甲亢相关表现，如心慌、手抖、多汗、食欲亢进但体重减轻等。甲减期表现：随着病情进展，当甲状腺滤泡储存的甲状腺激素消耗殆尽，部分患者会进入甲减期，出现怕冷、乏力、嗜睡、便秘等表现，但这种甲减期一般是暂时性的，持续数周后多数患者可恢复正常甲状腺功能。