肝血管瘤的发病原因目前尚未完全明确，不过有一些相关因素被认为可能与之有关。
先天发育异常方面
血管发育异常： 肝血管瘤可能是先天性的血管发育异常导致。在胚胎发育过程中，血管形成过程出现了紊乱，使得肝脏内的血管结构异常增生，逐渐形成血管瘤。这种先天性的因素从胚胎时期就埋下了隐患。遗传因素影响： 有研究发现，部分肝血管瘤的发生可能与遗传因素相关。如果家族中有肝血管瘤患者，那么其亲属患肝血管瘤的风险可能会相对高一些，但具体的遗传方式还不是非常清晰，不过遗传因素在其中起到了一定的作用。
激素影响方面
女性激素影响： 女性患肝血管瘤的概率相对男性可能稍高一些，这可能与女性体内的激素水平有关。尤其是雌激素，有研究推测雌激素可能会对肝内血管的生长产生一定的影响。在青春期、孕期等女性激素水平变化较大的时期，肝血管瘤的发生或发展可能会受到一定影响。比如孕期女性，由于体内雌激素、孕激素水平大幅升高，可能会促使原本存在的微小肝血管瘤有所增大。其他激素相关： 除了雌激素外，其他一些激素也可能与肝血管瘤的发生有一定关联，但目前相关研究还在进一步探索中。不过可以确定的是，激素水平的变化在肝血管瘤的发病机制中是一个需要关注的方面。
后天因素影响
肝脏外伤： 肝脏受到外伤后，可能会引起局部血管的损伤，进而导致血管修复过程中出现异常增生，形成血管瘤。比如腹部受到撞击等外伤情况，可能会诱发肝血管瘤的形成。不过这种情况相对来说不是最主要的诱发因素，但也是一个可能的后天因素。感染因素： 某些感染可能也与肝血管瘤的发生有一定关系。例如，有研究发现部分肝血管瘤患者在发病前有过肝脏的感染病史，感染可能会引起肝脏局部的炎症反应，炎症刺激可能导致血管的异常增生，从而形成血管瘤。但目前关于感染因素与肝血管瘤的具体关联机制还需要更多的研究来明确。