怀孕初期孕酮低的原因主要包括黄体功能不足、甲状腺功能失调以及生理性因素。具体如下：
一、黄体功能不足。当黄体功能出现异常时，会导致孕酮值降低，甚至在25ng/ml以下。此时需要到医院进行详细检查，明确到底是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因引起的，以便进一步采取针对性治疗措施。
1.内分泌疾病：某些内分泌系统的异常可能影响黄体功能，进而导致孕酮低。
2.胚胎染色体异常：胚胎自身存在染色体问题也可能引发这种情况。
二、甲状腺功能失调。如果孕妇甲状腺功能失调，体内会产生胰岛素抗体，从而造成孕酮水平降低。
三、生理性因素。孕酮属于一种释放性激素，所以在不同时间进行测量，其数值可能会有较大波动。
对于怀孕初期孕酮低的治疗方法有：
一、生活方面。
1.可以多吃富含维生素、豆类和果胶类的食物。
2.饮食宜清淡为主，要多补充叶酸。
3.调节体内分泌，注意休息。
4.每天坚持适当走动，活动身体。
5.避免性行为。
6.保持心情舒畅，不要过度忧郁。
二、药物治疗。
1.可以服用黄体酮胶囊药物。
2.或者通过肌肉注射来及时补充黄体酮，以改善孕酮过低的状况。
3.如果情况过于严重，需根据医生建议进行保胎治疗，此时最好卧床休息，避免各种剧烈活动。具体用药应严格遵循医师嘱托。
总结：怀孕初期孕酮低的原因包括黄体功能不足、甲状腺功能失调和生理性因素，需要根据具体情况进行检查和治疗，在生活方面要注意多方面的调整，药物治疗要遵医嘱进行。