鼻窦炎并没有绝对的“特效药”，治疗药物需根据病情类型等因素选择。一般来说，急性鼻窦炎常用抗生素等药物，如阿莫西林克拉维酸钾等，疗程通常在7-10天左右；而慢性鼻窦炎可能会用到鼻用糖皮质激素，如布地奈德鼻喷雾剂等。
急性鼻窦炎常用药物
抗生素类药物： 如果是细菌感染引起的急性鼻窦炎，常用抗生素来抗感染。比如阿莫西林克拉维酸钾，一般适用于多数敏感菌感染，但用药前需确认患者不对青霉素类药物过敏等情况。通常疗程大概是7 - 10天。鼻用减充血剂： 像麻黄碱滴鼻液等，可以减轻鼻腔黏膜充血肿胀，缓解鼻塞症状，但这类药物一般连续使用不宜超过7天，以免引起药物性鼻炎。
慢性鼻窦炎常用药物
鼻用糖皮质激素： 例如布地奈德鼻喷雾剂，能减轻鼻腔炎症反应，减轻鼻黏膜的水肿，一般需要持续使用数周甚至数月，具体根据病情而定。使用时要注意正确的喷鼻方法。黏液促排剂： 如桉柠蒎肠溶软胶囊，可以促进鼻腔和鼻窦内黏液的排出，改善鼻窦的通气引流，一般建议在饭前用凉开水送服。
特殊人群用药注意
儿童鼻窦炎患者： 儿童使用药物需格外谨慎。比如抗生素的选择，要根据儿童的年龄、体重等情况来选用合适的品种，像一些头孢类抗生素，要注意儿童的过敏史等。鼻用减充血剂一般不建议儿童使用，以免影响鼻腔正常发育等。孕妇鼻窦炎患者： 孕妇患鼻窦炎时用药需非常谨慎。很多药物可能会对胎儿产生影响，一般会优先选择局部的安全治疗方式，如生理盐水冲洗鼻腔等缓解症状，若必须用药，需在医生严格评估后选择对胎儿影响最小的药物。
药物治疗外的辅助措施
除了药物治疗，还可以配合鼻腔冲洗，使用生理盐水或生理性海水进行鼻腔冲洗，每天可以进行1 - 2次，能清除鼻腔内的分泌物、过敏原等，有助于鼻窦炎的恢复。同时，要注意休息，多喝水，避免接触过敏原等，这些对于鼻窦炎的康复也有帮助。