13岁小女孩月经不正常可能与以下因素有关：
下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能尚未健全：女孩的下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能尚未健全，大运动量可使女孩在初潮后的一段时间内，月经周期不规则，经期延长，经血量多，甚至增加子宫出血的可能性。
情绪波动：学习压力过大、精神长期紧张、情绪波动较大等，可能会影响内分泌，导致卵巢功能失调，引起月经紊乱。
营养不良：部分女孩为了追求身材苗条而过度节食，导致体内能量摄入不足，影响体内雌激素的正常合成，进而影响月经来潮，出现月经量少或闭经等情况。
其他：肾上腺皮质功能亢进、甲状腺功能异常等疾病，也可能导致月经异常。
如果小女孩出现月经不正常的情况，家长应及时带其就医，进行相关检查，如激素六项、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意让小女孩保持良好的生活习惯，保证充足的睡眠，避免过度劳累；保持心情愉悦，避免情绪波动过大；合理饮食，加强营养，避免过度节食。