肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，其临床症状多样。一般来说，肠结核患者常出现腹痛症状，多为右下腹隐痛或钝痛，有时也会表现为全腹隐痛，疼痛程度不一。
消化系统症状表现
腹痛： 多数患者有右下腹疼痛，疼痛性质多为隐痛或钝痛，有时在进食后会加重，这是因为进食会引起胃肠蠕动或诱发肠内容物通过病变部位，从而刺激病灶导致疼痛。腹泻与便秘交替： 溃疡型肠结核患者常出现腹泻，粪便多为糊样，一般无脓血，每日数次不等，有时会伴有腹痛，排便后腹痛可缓解；而增生型肠结核多以便秘为主要表现。
全身症状情况
发热： 患者可出现低热，体温一般在37.5℃~38℃之间，午后较为明显，部分患者还可能伴有盗汗，夜间睡眠时出汗较多，这是结核中毒的常见表现。消瘦、乏力： 由于结核分枝杆菌感染导致机体消耗增加，患者会逐渐出现消瘦，体重下降，同时伴有乏力，精神状态欠佳。
腹部体征表现
腹部压痛： 右下腹常有固定的轻压痛，这是因为病变主要累及右下腹肠道。腹部肿块： 增生型肠结核可触及腹部肿块，质地中等，比较固定，伴有轻度或中度压痛。如果是溃疡型肠结核合并有周围组织粘连，也可能触及肿块，但一般压痛较明显。
其他表现
肠道外结核表现： 部分患者可能同时伴有肺结核等肠道外结核的表现，如咳嗽、咳痰等呼吸系统症状。如果是女性患者，还可能出现月经不调等生殖系统相关表现，这是因为结核分枝杆菌感染可累及多个系统。