非淋菌性尿道炎主要由沙眼衣原体、生殖支原体等感染引起，治疗一般需要1~2周左右的时间。治疗时常用的药物有阿奇霉素、多西环素等。
药物选择要点
阿奇霉素： 属于大环内酯类抗生素，对沙眼衣原体等有较好的抗菌作用。一般单次口服一定剂量即可，但要遵医嘱使用。多西环素： 属于四环素类抗生素，对非淋菌性尿道炎的病原体有抑制作用，口服给药。
治疗中的注意事项
性伴侣同时治疗： 在治疗非淋菌性尿道炎期间，患者的性伴侣也需要一同检查和治疗，避免交叉感染，影响治疗效果，一般建议在治疗开始后的7~10天内性伴侣接受检查和相应处理。避免饮酒： 治疗期间饮酒可能会加重炎症反应，还可能影响药物的代谢和疗效，所以治疗期间要严格戒酒，至少在用药期间及停药后短期内都不要饮酒。
特殊人群的处理
孕妇： 孕妇患非淋菌性尿道炎时用药需谨慎，一般会选择对胎儿影响较小的药物，如红霉素等，但具体用药要由医生根据孕妇的具体情况来权衡利弊后决定，因为某些药物可能会通过胎盘影响胎儿发育。儿童： 儿童患非淋菌性尿道炎相对较少见，若儿童患病，用药更要格外谨慎，一般会选择安全性较高的药物，且剂量要严格按照儿童的体重等情况进行计算，需要在医生的严密监测下用药。