5个月婴儿晚上莫名大哭的原因包括：白天受到惊吓、胃肠道不适、微量元素缺乏等。具体如下：
一、白天受到惊吓：
1.宝宝白天听到巨大噪声、狗叫等情况，可能会受到惊吓。
2.受惊吓后会在夜晚出现梦中惊醒、哭闹、使劲打挺等表现。
3.家长要注意保持周边环境安静，避免小儿神经过度兴奋。
二、胃肠不适：
1.宝宝晚餐进食过多或进食不易消化食物，入睡后可能有腹胀、腹痛等症状，从而导致梦中惊醒。
2.建议家长喂食时注意晚餐适量，多给宝宝进食清淡、易消化食物，也可以用手摩擦患儿腹部促进胃肠消化。
3.或是夜间腹部着凉引起肠道痉挛，此时家长要注意腹部保暖，可用热毛巾热敷腹部，用手摩擦患儿腹部来缓解肠道痉挛不适等症状。
三、缺钙：
1.一般建议及时到医院就诊，检查微量元素。
2.确诊后制定治疗方案，可口服小儿鱼肝油滴剂、葡萄糖酸钙口服液等，必要时给予口服维生素D3促进钙的吸收等治疗。
总之，5个月婴儿晚上莫名大哭可能是多种原因引起的，家长需仔细观察和分析，针对具体情况采取相应的措施。如果问题持续或加重，应及时就医。