小脑萎缩目前尚无特效药物能完全根治，但可以通过一些药物来缓解症状或延缓病情进展。比如丁苯酞软胶囊，可改善脑缺血区的微循环和血流量，增加缺血区的供血供氧；胞磷胆碱钠片能促进大脑功能恢复，改善脑代谢。不过药物治疗需在医生指导下进行。
改善共济失调症状的药物
丁苯酞软胶囊： 它能抑制谷氨酸释放，减少氧自由基和提高脑血管内皮NO和PGI2的水平，改善缺血脑区的微循环和血流量，增加缺血区毛细血管数量，促进神经功能恢复。一般用于轻、中度急性缺血性脑卒中。甲钴胺片： 属于神经营养药物，参与一碳单位循环，在由同型半胱氨酸合成蛋氨酸的转甲基反应过程中起重要作用，能促进轴突运输功能和轴突再生，使延迟的神经突触传递和神经递质减少恢复正常，适用于周围神经病。
针对伴随症状的药物
若有震颤症状： 可考虑使用盐酸苯海索片，它能阻断中枢胆碱能受体，减弱黑质-纹状体通路中乙酰胆碱的作用和降低网状结构-丘脑及丘脑-皮质投射系统的兴奋性，发挥抗胆碱、抗震颤作用，但青光眼、尿潴留患者禁用。若有认知障碍： 多奈哌齐片可能有一定帮助，它可逆性地抑制乙酰胆碱酯酶对乙酰胆碱的水解，从而提高乙酰胆碱的浓度，改善阿尔茨海默病患者的认知功能，但严重肝脏损害者慎用。
康复辅助相关药物
奥拉西坦胶囊： 可促进磷酰胆碱和磷酰乙醇胺合成，提高大脑中ATP/ADP的比值，使大脑中蛋白质和核酸的合成增加，有助于改善脑代谢，对智力与记忆力的改善有一定辅助作用，适用于轻中度血管性痴呆、老年性痴呆以及脑外伤等症引起的记忆与智能障碍。需要注意的是，小脑萎缩的药物治疗只是综合治疗的一部分，还需要结合康复训练等其他措施来提高患者的生活质量。而且不同患者病情不同，用药也会有差异，必须在医生的评估和指导下选择合适的药物，不能自行随意用药。同时，一些药物可能会有不良反应，用药过程中要密切关注身体状况，如有不适及时就医调整治疗方案。