月经过后两天同房后小腹隐痛可能与以下因素有关。
1.生理因素：
子宫收缩：同房时，男性阴茎对子宫颈的刺激可能引起子宫收缩，导致小腹隐痛。这种疼痛通常是短暂的，会自行缓解。
阴道损伤：同房时动作过于粗暴或润滑不足可能导致阴道黏膜损伤，引起疼痛。
2.病理因素：
盆腔炎：月经过后，女性生殖系统抵抗力较弱，若存在感染，容易引发盆腔炎，导致小腹隐痛、坠胀等不适。
子宫内膜异位症：子宫内膜异位到子宫肌层或其他部位，在同房刺激下可能引起疼痛。
其他：子宫肌瘤、宫颈炎等疾病也可能导致同房后小腹隐痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如白带异常、发热等，应及时就医，进行妇科检查、B超等检查，以明确原因并进行相应的治疗。
此外，为了减少同房后小腹隐痛的发生，建议注意以下几点。
1.保持卫生：同房前后双方应清洗外阴，减少感染的机会。
2.注意动作：动作应轻柔，避免过度刺激。
3.治疗疾病：如果存在妇科疾病，应积极治疗，待疾病痊愈后再同房。
4.观察身体变化：注意观察每次同房后小腹隐痛的情况，以及是否有其他异常症状，以便及时发现问题。
需要注意的是，每个人的身体状况不同，因此如果对同房后小腹隐痛有疑虑或担忧，最好咨询医生的意见，以便获得更专业的建议和治疗。