马拉色菌毛囊炎主要通过抗真菌药物治疗。一般来说，经过规范治疗，多数患者可在数周内改善症状。
外用抗真菌药物选择
酮康唑洗剂：可先用酮康唑洗剂清洗患处，能抑制马拉色菌生长。一般建议每周使用2 - 3次，连续使用数周。联苯苄唑乳膏：这是常用的外用抗真菌药膏，直接涂抹在患处，一天1 - 2次，坚持使用一段时间能起到抗真菌作用。
口服抗真菌药物情况
伊曲康唑：对于病情较重的患者，可考虑口服伊曲康唑。但需要在医生评估下使用，一般疗程需要数周，使用前要检查肝功能等指标。氟康唑：也可作为口服抗真菌药物选择之一，同样要在医生指导下使用，注意药物可能对肝脏等器官的影响，用药过程中需监测相关指标。
日常护理要点
保持皮肤清洁干燥：患者要注意保持患病部位皮肤的清洁，每天用温水清洗，洗完后及时擦干，尤其是在出汗后要尽快清洁，因为马拉色菌喜欢温暖潮湿的环境，保持干燥可抑制其繁殖。衣物选择：穿着宽松、透气的棉质衣物，避免穿紧身不透气的衣物，防止局部环境闷热潮湿，不利于病情恢复。比如夏季可选择棉质短袖、短裤等，让皮肤能更好地呼吸。避免搔抓：患病部位皮肤可能会有瘙痒感，但要避免用手搔抓，以免抓破皮肤引起感染，加重病情，同时搔抓还可能导致马拉色菌扩散到身体其他部位。
饮食注意事项
减少油腻食物摄入：马拉色菌毛囊炎患者应减少高脂肪、高糖食物的摄取，像油炸食品、奶油蛋糕等要少吃，因为这类食物可能会促进皮脂腺分泌更多油脂，为马拉色菌提供更有利的生长环境。多吃蔬菜水果：多吃富含维生素的蔬菜水果，如苹果、橙子、菠菜、西兰花等，有助于增强身体免疫力，对病情恢复有一定帮助。