如果发生药流不全且不进行清宫，可能导致持续性出血，还可能引发感染、继发不孕等不良后果。但药物流产并非一定得清宫，药物流产存在20%的失败率，即约五分之一的患者会药流失败，此时就需要进行清宫手术。而约80%的患者会药流成功，药流成功则无需进行清宫手术操作，毕竟手术操作可能对子宫内膜造成一定损伤。
清宫手术的目的是清除宫腔内残留的东西，以避免再次出血、大出血，或者因出血时间过长而引起的逆行感染，这种逆行感染可能导致子宫内膜炎、输卵管炎，进而影响日后怀孕。
要是药流清宫后仍有残留，可能会因为流血时间长、宫腔内有组织物残留而引发大出血现象，或者长时间流血导致宫腔感染，而宫腔感染会逆行至输卵管、卵巢和盆腔，引发盆腔炎。这会造成输卵管堵塞或半堵塞状态，引起子宫内膜炎，可能会导致宫腔粘连。在这种情况下，会对以后的怀孕产生一定影响，并且盆腔炎还会导致腹痛甚至发烧，形成盆腔脓肿等严重后果。
总结：药流不全不清宫后果严重，药物流产有一定失败率，失败需清宫，清宫可避免不良后果，若清宫后仍有残留会带来一系列危害影响怀孕和健康。