怀孕40天不建议同房。怀孕前3个月和后3个月，应尽量避免同房，因为在怀孕前3个月，胎盘尚未发育成熟，胚胎附着于子宫尚不牢固，同房可能会导致子宫收缩，增加流产的风险；在怀孕后3个月，胎儿生长迅速，子宫明显增大，同房可能会导致胎膜早破、早产等情况。
怀孕40天时，孕囊较小，同房一般不会对胎儿造成太大影响，但也可能会出现一些问题，如：
先兆流产：怀孕40天时，孕囊着床尚不稳定，同房可能会刺激子宫收缩，导致先兆流产，出现阴道少量流血、下腹疼痛等症状。
感染：同房时，如果没有注意卫生，可能会导致细菌上行感染，引起子宫内膜炎、盆腔炎等疾病，影响孕妇和胎儿的健康。
胎膜早破：怀孕40天时，胎膜早破的发生率较低，但也不能完全排除。如果同房时动作过于剧烈，可能会导致胎膜早破，增加早产的风险。
因此，为了确保孕妇和胎儿的健康，建议在怀孕前3个月和后3个月尽量避免同房。如果在怀孕期间有任何不适，应及时就医。