刚怀孕40天不建议同房。怀孕前三个月和后三个月应避免同房，怀孕早期（前三个月）胎盘和子宫壁连接还不紧密，如果进行性生活，可能会由于动作不当或过度兴奋，使子宫受到震动，从而引起胎盘脱落，导致流产。怀孕后期（后三个月），孕妇腹部明显隆起，身体比较笨拙，行动不便，此时同房容易压迫腹部，对胎儿和孕妇都不利。
怀孕40天时属于孕早期，此时胎盘还没有完全形成，孕囊在子宫内还不稳定，是流产的高发期。如果在此期间进行性生活，可能会刺激子宫收缩，增加流产的风险。此外，孕早期孕妇体内的孕激素水平较低，阴道和子宫颈的黏膜也比较脆弱，性生活可能会导致细菌感染，增加阴道炎、宫颈炎等疾病的发生几率，进而影响胎儿的发育。
如果在怀孕40天时已经进行了性生活，需要注意观察是否有腹痛、阴道流血等异常情况。如果出现异常，应及时就医，进行保胎治疗。同时，在整个孕期，孕妇都应该注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。此外，还应该注意休息，避免过度劳累，保持良好的心态，均衡饮食，定期进行产前检查，以确保胎儿的健康发育。