紫菜本身一般没有严重的副作用，但如果食用不当可能会带来一些问题。一般来说，正常适量食用紫菜不会有明显不适，但有些人可能对紫菜过敏，过敏人群食用后可能出现皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等症状。
过敏人群需注意
过敏体质者： 对于本身是过敏体质的人，尤其是对海产品过敏的人群，食用紫菜后发生过敏反应的风险相对较高。这类人群在食用紫菜前最好先少量尝试，观察是否有不适症状出现。如果出现过敏症状，应立即停止食用紫菜，并及时就医治疗。
食用过量的影响
可能导致消化不良： 如果一次性食用过多的紫菜，可能会加重胃肠道的消化负担，引起消化不良。因为紫菜中含有一定量的膳食纤维，过量食用会使胃肠道蠕动加快，但如果超过了胃肠道的消化能力，就容易出现腹胀、腹痛、腹泻等消化不良的症状。一般建议每次食用紫菜的量控制在适量范围内，比如每餐食用紫菜的量以5 - 10克左右较为合适。
与药物相互作用方面
可能影响某些药物吸收： 有研究表明，紫菜中含有一些成分可能会与某些药物发生相互作用，从而影响药物的吸收。例如，正在服用某些抗生素类药物的人，如果大量食用紫菜，可能会干扰抗生素在体内的吸收过程，降低药物的疗效。所以，正在服药的人群如果要食用紫菜，最好咨询医生的意见，了解是否会存在药物相互作用的情况。