胆囊结石形成的原因较为复杂，主要与胆汁成分改变、胆囊收缩功能异常等因素有关。据统计，胆囊结石的发生与多种因素相关，其中胆汁中胆固醇、胆色素等成分比例失调是重要原因之一。
胆汁成分失衡导致
胆固醇过饱和： 当胆汁中胆固醇含量过高，超过了胆汁酸和卵磷脂所能溶解的限度时，胆固醇就容易析出结晶，逐渐形成结石。比如，长期高脂肪饮食的人，体内胆固醇合成增加，就容易使胆汁中胆固醇过饱和。胆色素代谢异常： 胆道感染时，细菌、寄生虫等可使胆汁中的胆色素发生变化，形成胆色素结石。像肠道寄生虫蛔虫进入胆道，就可能干扰胆色素的代谢，增加胆色素结石形成风险。
胆囊收缩功能问题
胆囊排空延迟： 一些人胆囊收缩功能出现障碍，导致胆汁排出不畅，胆汁在胆囊内长时间潴留，胆汁中的成分就会浓缩，进而容易形成结石。例如，长期不规律进食，尤其是不吃早餐的人，胆囊收缩不规律，排空延迟，增加胆囊结石发生几率。胆囊黏膜受损： 胆囊黏膜受到炎症等刺激时，其正常的分泌和吸收功能会受到影响，也可能促使结石形成。比如患有慢性胆囊炎的患者，胆囊黏膜长期受炎症刺激，更容易长出结石。
其他相关因素影响
性别与年龄： 女性患胆囊结石的几率相对较高，可能与女性体内雌激素水平变化有关。而且随着年龄增长，胆囊功能逐渐衰退，胆囊结石的发生率也会增加，50岁左右人群相对更易患胆囊结石。遗传因素： 部分胆囊结石具有一定的遗传倾向，如果家族中有胆囊结石患者，那么其亲属患胆囊结石的风险可能会比常人高一些。