甲状腺炎的治疗需根据不同类型来选择最佳方案。一般来说，对于亚急性甲状腺炎，约有50%的患者在数周内可自行缓解，但也有部分患者需要药物干预。
亚急性甲状腺炎的治疗
药物缓解疼痛： 非甾体抗炎药如阿司匹林，可用于缓解轻度疼痛和发热，一般能在数天内减轻症状。如果非甾体抗炎药效果不佳，还可考虑使用糖皮质激素，如泼尼松，能快速缓解疼痛和炎症，但使用时需注意可能出现的副作用。监测甲状腺功能： 亚急性甲状腺炎可能会出现甲状腺功能亢进期、甲减期等不同阶段，需要定期监测甲状腺功能，若出现甲减，必要时可短期补充甲状腺激素，如左甲状腺素钠片。
自身免疫性甲状腺炎的治疗
观察与随访： 对于无症状的慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本甲状腺炎）患者，主要是定期随访，一般每6-12个月检查甲状腺功能和甲状腺超声。当甲状腺功能正常时，通常只需定期监测即可。调整甲状腺激素： 如果出现甲减，就需要长期服用左甲状腺素钠片来替代治疗，将甲状腺功能维持在正常范围。治疗过程中要根据甲状腺功能检查结果调整药物剂量。
感染性甲状腺炎的治疗
抗感染治疗： 细菌感染引起的甲状腺炎需要使用抗生素进行抗感染治疗，根据感染的细菌种类选择合适的抗生素，如头孢菌素类等。在使用抗生素前可能需要进行细菌培养和药敏试验以选择敏感抗生素。对症处理： 同时针对甲状腺炎引起的发热、疼痛等症状进行对症处理，如使用退烧药等。