先天性心脏病有一定遗传倾向，但不是绝对会遗传给下一代。有研究显示，如果家族中有先心病患者，其子女患先心病的风险比普通人群高2%~10%左右。
遗传因素的具体情况
单基因遗传因素： 某些单基因遗传病会引发先天性心脏病，比如21-三体综合征患儿常伴有先天性心脏病，其是由于21号染色体多了一条导致的单基因相关畸变，这类遗传是由特定的基因突变引起，有明显的遗传规律，家族中若有此类基因缺陷者，后代患病风险较高。多基因遗传因素： 先天性心脏病多数是多基因遗传所致，是多个基因与环境因素相互作用的结果。比如环境中的某些因素，像孕妇在妊娠早期接触放射性物质、服用某些致畸药物等，再加上自身携带的多个易感基因，就会增加胎儿患先天性心脏病的几率。但不是有易感基因就一定会发病，只是比没有易感基因的人群发病风险高。
环境因素的影响
孕妇孕期感染： 孕妇在怀孕前3个月内感染风疹病毒，胎儿患先天性心脏病的概率会大大增加，可达10%~20%左右。比如孕妇感染风疹后，病毒可通过胎盘影响胎儿心脏发育，导致心脏结构异常。孕妇孕期不良生活习惯： 孕妇酗酒，酒精可通过胎盘影响胎儿，使胎儿患酒精性心脏病的风险升高；孕妇吸烟，烟草中的尼古丁等有害物质会影响胎盘血液循环，造成胎儿缺氧，增加先天性心脏病发生的可能。
预防及注意事项
婚前检查很重要： 准备结婚的男女双方进行婚前检查，了解双方家族中是否有先天性心脏病病史等情况，若发现有遗传方面的潜在风险，可进行遗传咨询，评估后代患病风险。孕期保健要做好： 孕妇妊娠早期要避免接触有害物质，如远离放射性物质、化学毒物等；按时进行产检，通过超声等检查手段早期发现胎儿心脏发育异常情况；保持健康的生活方式，戒烟戒酒，合理饮食，适量运动，保持良好的心态。新生儿筛查： 新生儿出生后要进行先天性心脏病的筛查，一般在出生后不久通过心脏听诊、超声心动图等检查，争取在早期发现先天性心脏病，及时进行干预治疗。