两只眼睛不对称能够进行矫正，常见的矫正方式包括物理治疗、开眼角手术、斜视矫正术等。
一、物理治疗：若因长期过度用眼导致眼肌疲劳，进而引发眼肌痉挛、两眼不对称。这时可以采取以下措施。
1.热敷：用热毛巾敷5至10分钟。
2.按摩：沿上眼眶左右反复按摩，可促进血液循环，有效缓解眼部肌肉紧张、痉挛的状况，从而改善双眼不对称问题。
二、开眼角手术：如果是因为内眦赘皮，从而出现大小眼、两眼不对称的情况。此时可进行开内眼角手术，将增生的皮肤组织切除，就能达到改善双眼不对称的效果。
三、斜视矫正术：若因先天性遗传、颅脑损伤等因素，致使眼外肌的运动功能出现障碍，造成双眼不能正视前方、双眼不对称的现象，那么可以通过斜视矫正，采用手术移位、缝合眼外肌等方式，来调整眼外肌的长度和着力点，进而调整其对眼球的牵拉力，以改善双眼不对称的症状。需要注意的是，这些手术方式都应在正规医院进行操作。
总之，对于双眼不对称的情况，可根据具体原因选择合适的矫正方法，但都要确保在专业的医疗机构进行。