起床眼睛肿的原因可能有长时间揉搓眼部、睑腺炎、过敏等。需及时就医检查并治疗。具体如下：
一、长时间揉搓眼部：在日常生活中，如果不注重个人卫生，经常用手长时间揉眼睛，会使眼睛部位的毛细血管异常扩张，进而导致起床后眼睛肿。这种情况通常无需特殊治疗，只要做好卫生清洁工作即可。
二、睑腺炎：自身抵抗力较弱，接触了受细菌污染的毛巾、脸盆等清洁用品，导致眼部滋生大量细菌，从而引发睑腺炎。在炎症刺激下，会出现起床眼睛肿的状况。治疗上可遵医嘱使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等药物。
三、过敏：眼睛部位接触到如柳絮、动物毛发、灰尘等过敏物质，且没有及时清洁，也会引起起床眼睛肿。可遵医嘱服用醋酸泼尼松龙片、地塞米松片、盐酸左西替利嗪片等药物进行治疗。
建议患者治疗期间严格按照医嘱服用相应剂量的药物，切不可自行更改药物剂量，以免影响疾病恢复。